一种改善动物胃肠道健康的发酵中药口服液及其制备方法，该发酵中药口服液包括以下质量份数的组分：黄芪100份、黄芩50份、苦参90份、白芨80份、莱菔子80份、甘草50份、茯苓50份、陈皮100份、茵陈100份、山楂300份、酪蛋白胨12份、酵母粉10份、轻质碳酸钙2份、氯化钾1份、硫酸镁1份、植物乳杆菌1.5份、副干酪乳杆菌1.5份、乳酸片球菌1份、罗伊氏乳杆菌1份。本发明通过筛选动物胃肠道功能性益生菌，针对中药煎煮液的成分和特性，进行科学配伍，然后投放到含培养基的中药煎煮液后，益生菌会生长繁殖，并对中药成分进行转化和预转化，代谢出有效成分和活性因子，能够加快药效、提高利用率、改善口感、增加安全性，从而有效改善动物胃肠道健康。